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故事的舞台是迎接了新时代的日本。大企业「飞电Intelligence」研发的搭载人工智能（AI）的人型机器人．Humagear被派遣到各行各业的工作现场。作工精细且拥有如真人般外貌的Humagear，一下子便融入了人们的生活中。可是，企图使人类灭亡的恐怖组织「灭亡迅雷.net」却到处骇入Humagear，使Humagear变成袭击人类的杀戮兵器MAGiA。骤逝的「飞电Intelligence」前任社长．飞电是之助早一步料到这个危机，将人类和Humagear的未来托付给孙子或人。或人变身成假面骑士ZERO-ONE，为了阻止失控的MAGiA而战。另一方面，政府设立的特务机关「A.I.M.S.」也开
